Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csnk2a1Q60737 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms