Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sik1Q60670 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sik1Q60670 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms