Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV6

Lmtk3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk3Q5XJV6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmtk3Q5XJV6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmtk3Q5XJV6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms