Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF90

Atp13a4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a4Q5XF90 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp13a4Q5XF90 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp13a4Q5XF90 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp13a4Q5XF90 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a4Q5XF90 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a4Q5XF90 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a4Q5XF90 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a4Q5XF90 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a4Q5XF90 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a4Q5XF90 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a4Q5XF90 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a4Q5XF90 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a4Q5XF90 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a4Q5XF90 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a4Q5XF90 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms