Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Scaf1Q5U4C3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scaf1Q5U4C3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms