Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brip1Q5SXJ3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms