Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms