Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r195Q5SVD6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms