Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms