Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf215Q5SPX3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms