Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms