Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttf2Q5NC05 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms