Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpm3Q5F4S9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpm3Q5F4S9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms