Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fam208bQ5DTT3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam208bQ5DTT3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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