Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f8Q58FA4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E2f8Q58FA4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms