Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrig2Q52KR2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms