Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc84Q4VA36 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms