Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc3lQ4KL14 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms