Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx49Q4FZF3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms