Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1nQ497L1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms