Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rimbp3Q3V0F0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rimbp3Q3V0F0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rimbp3Q3V0F0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms