Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrfip1Q3UZ39 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms