Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn13Q3UW68 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn13Q3UW68 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms