Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nr1d1Q3UV55 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms