Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chpf2Q3UU43 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms