Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc38a11Q3USY0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms