Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
B230104I21RikQ3USW4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
B230104I21RikQ3USW4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
B230104I21RikQ3USW4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
B230104I21RikQ3USW4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
B230104I21RikQ3USW4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
B230104I21RikQ3USW4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms