Protein–RNA interactions for Protein: Q3UST5

UPF0764 protein C16orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UST5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UST5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UST5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UST5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UST5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UST5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UST5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UST5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UST5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UST5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UST5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UST5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UST5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UST5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UST5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UST5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UST5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UST5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UST5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UST5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UST5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UST5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UST5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3UST5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3UST5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3UST5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3UST5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3UST5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3UST5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3UST5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3UST5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3UST5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3UST5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3UST5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3UST5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3UST5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3UST5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3UST5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3UST5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3UST5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3UST5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3UST5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3UST5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3UST5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3UST5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3UST5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3UST5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3UST5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3UST5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3UST5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3UST5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3UST5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3UST5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3UST5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3UST5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3UST5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3UST5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3UST5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3UST5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3UST5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3UST5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3UST5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3UST5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3UST5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3UST5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3UST5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3UST5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3UST5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3UST5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3UST5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3UST5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3UST5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3UST5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3UST5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3UST5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3UST5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3UST5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3UST5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3UST5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3UST5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3UST5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3UST5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3UST5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3UST5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3UST5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3UST5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3UST5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3UST5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3UST5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3UST5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3UST5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3UST5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3UST5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3UST5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3UST5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3UST5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3UST5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3UST5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3UST5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3UST5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms