Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms