Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQU0

Brd9, Bromodomain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd9Q3UQU0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Brd9Q3UQU0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd9Q3UQU0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms