Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrc4Q3UP24 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrc4Q3UP24 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrc4Q3UP24 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrc4Q3UP24 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrc4Q3UP24 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrc4Q3UP24 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrc4Q3UP24 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrc4Q3UP24 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrc4Q3UP24 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrc4Q3UP24 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrc4Q3UP24 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrc4Q3UP24 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrc4Q3UP24 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrc4Q3UP24 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrc4Q3UP24 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrc4Q3UP24 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrc4Q3UP24 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrc4Q3UP24 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrc4Q3UP24 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrc4Q3UP24 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrc4Q3UP24 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrc4Q3UP24 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrc4Q3UP24 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrc4Q3UP24 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrc4Q3UP24 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms