Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd27Q3UMR0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd27Q3UMR0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms