Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms