Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pin1rt1Q3ULQ2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pin1rt1Q3ULQ2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pin1rt1Q3ULQ2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pin1rt1Q3ULQ2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pin1rt1Q3ULQ2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pin1rt1Q3ULQ2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pin1rt1Q3ULQ2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms