Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Edc4Q3UJB9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Edc4Q3UJB9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Edc4Q3UJB9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Edc4Q3UJB9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Edc4Q3UJB9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Edc4Q3UJB9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Edc4Q3UJB9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Edc4Q3UJB9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Edc4Q3UJB9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Edc4Q3UJB9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Edc4Q3UJB9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Edc4Q3UJB9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Edc4Q3UJB9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Edc4Q3UJB9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Edc4Q3UJB9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Edc4Q3UJB9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Edc4Q3UJB9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Edc4Q3UJB9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms