Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHN9

Ndst1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst1Q3UHN9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndst1Q3UHN9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndst1Q3UHN9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndst1Q3UHN9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndst1Q3UHN9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndst1Q3UHN9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndst1Q3UHN9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndst1Q3UHN9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndst1Q3UHN9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndst1Q3UHN9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndst1Q3UHN9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndst1Q3UHN9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndst1Q3UHN9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndst1Q3UHN9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms