Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms