Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mcrip1Q3UGS4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.4 ms