Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem109Q3UBX0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem109Q3UBX0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms