Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trip13Q3UA06 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms