Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf180Q3U827 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf180Q3U827 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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