Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kdm4dQ3U2K5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms