Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vars2Q3U2A8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vars2Q3U2A8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms