Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmem35bQ3U0Y2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem35bQ3U0Y2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmem35bQ3U0Y2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmem35bQ3U0Y2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem35bQ3U0Y2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem35bQ3U0Y2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem35bQ3U0Y2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms