Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl4Q3TZA2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl4Q3TZA2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms