Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
Ccdc136Q3TVA9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Ccdc136Q3TVA9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Ccdc136Q3TVA9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ccdc136Q3TVA9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ccdc136Q3TVA9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccdc136Q3TVA9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccdc136Q3TVA9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccdc136Q3TVA9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccdc136Q3TVA9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccdc136Q3TVA9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccdc136Q3TVA9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Ccdc136Q3TVA9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Ccdc136Q3TVA9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Ccdc136Q3TVA9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ccdc136Q3TVA9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ccdc136Q3TVA9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ccdc136Q3TVA9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ccdc136Q3TVA9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Ccdc136Q3TVA9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ccdc136Q3TVA9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ccdc136Q3TVA9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ccdc136Q3TVA9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ccdc136Q3TVA9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms