Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3TQQ9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q3TQQ9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TQQ9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TQQ9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TQQ9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TQQ9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TQQ9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TQQ9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Q3TQQ9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TQQ9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TQQ9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TQQ9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TQQ9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TQQ9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TQQ9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3TQQ9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3TQQ9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q3TQQ9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3TQQ9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3TQQ9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3TQQ9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3TQQ9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3TQQ9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3TQQ9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3TQQ9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3TQQ9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3TQQ9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3TQQ9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q3TQQ9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3TQQ9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Q3TQQ9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q3TQQ9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Q3TQQ9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3TQQ9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3TQQ9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q3TQQ9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Q3TQQ9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TQQ9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TQQ9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TQQ9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TQQ9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TQQ9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TQQ9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3TQQ9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3TQQ9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3TQQ9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3TQQ9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3TQQ9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q3TQQ9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3TQQ9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3TQQ9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3TQQ9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3TQQ9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3TQQ9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3TQQ9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3TQQ9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3TQQ9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q3TQQ9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q3TQQ9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q3TQQ9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms