Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uri1Q3TLD5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uri1Q3TLD5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uri1Q3TLD5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uri1Q3TLD5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Uri1Q3TLD5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Uri1Q3TLD5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Uri1Q3TLD5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uri1Q3TLD5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms