Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Smarca4Q3TKT4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Smarca4Q3TKT4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Smarca4Q3TKT4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms