Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RubcnlQ3TD16 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms